Người ta cho rằng bệnh Alzheimer biểu hiện rõ ràng hơn do sự tăng tích luỹ các đoạn peptide nhỏ như β- amyloid (A-β, gồm 40-42 amino acid). Sự hình thành các đoạn peptide A-β là do sự phân cắt prtotein từ một protein APP tiền thân dài hơn nhiều (đây là một protein bám màng) do hoạt động của hai enzyme protease. Hình dưới minh hoạ giả thuyết về sự hình thành phân tử A-β (hộp bôi đen trên hình), biểu diễn hoạt động theo trình tự enzyme β – secretase để tạo ra đầu N của A-β và enzyme γ – secretase để cắt phân tử tiền thân bên trong màng phospholipid để tạo ra dầu Carbon (C) của phân tử A-β. Các đơn phân A-β sau đó kết hợp lại với nhau tạo thành các đoạn peptide ngắn (oligo) không tan và các sợi có tính độc.